在执行完毕后申请人不配合结案，可参考以下不同情况采取相应的解决办法，不一定都需要通过法律手段来解决：

    与申请人沟通协商

    直接沟通 ：执行案件通常是由法院执行局负责推进的，执行员可以主动联系申请人，向其说明执行已经完毕的事实，包括被执行人已经按照执行依据完全履行了义务，如支付了全部款项、完成了特定行为等。提醒申请人配合法院办理结案手续是其应尽的义务，避免因不结案给双方当事人带来不必要的麻烦。

    释明利害 ：向申请人解释不结案可能对其自身产生的不利影响，比如可能会影响其后续再次申请执行的效率，也可能影响法院对其信用记录的评价等。同时，强调及时结案对于维护司法秩序和保障当事人合法权益的重要性。

    法院依职权结案

    符合条件可直接结案 ：根据相关法律规定和司法实践，当执行案件具备执行完毕的法定情形时，即使申请人不配合，法院也有权依职权结案。例如，被执行人已经按照生效法律文书确定的内容全部履行义务，或者通过强制执行措施已经实现了申请执行人的债权等。法院可以在完成必要的审批程序后，直接作出结案处理，并记录在案。

    送达结案通知 ：法院依职权结案后，应及时向申请人送达结案通知书，告知其案件已经结案的事实和依据。同时，将结案情况录入相关的司法信息系统，以便当事人和社会公众查询。

    法律手段（一般较少使用）

    申请人恶意不结案 ：如果申请人无正当理由恶意不配合结案，且给被执行人造成了实际损失，如影响被执行人的信用评级、限制其正常生产经营活动等，被执行人可以通过提起民事诉讼的方式，要求申请人承担相应的赔偿责任。但这种情况在实践中相对较少，需要有充分的证据证明申请人存在恶意行为和实际损失的存在。

    启动司法制裁程序 ：在极端情况下，如果申请人的行为严重干扰了司法秩序，法院可以根据《民事诉讼法》的相关规定，对其采取罚款、拘留等司法制裁措施。但这通常是在其他方法都无法解决问题，且申请人的行为情节较为严重时才会采用。