非婚生子有出生证明但上男方户口还被要求做亲子鉴定，主要有以下几方面原因：

    从法律和户籍管理的严谨性角度

    防止虚假出生证明 ：虽然你持有出生证明，但在非婚生育的情况下，存在一些人可能通过不正当手段获取虚假出生证明，以此来为孩子办理户口登记。通过亲子鉴定，可以进一步核实孩子与男方之间的生物学亲子关系，确保户籍信息的真实性和准确性，避免违法违规的户口登记行为。

    明确亲子关系 ：在非婚生育的情形下，仅凭借出生证明可能无法完全确定孩子与男方的亲子关系。出生证明上登记的父亲信息可能存在错误、虚假填报或者其他特殊情况。而亲子鉴定是通过科学的方法来确定亲子关系，其结果具有权威性和准确性，能为户籍登记提供更可靠的依据。

    从保护各方权益角度

    保障男方权益 ：对于男方而言，亲子鉴定可以确保他确实是孩子的生物学父亲，避免在不知情的情况下承担非亲生子女的抚养等责任。这也是对男方知情权和合法权益的一种保护。

    保障孩子权益 ：准确的亲子关系认定有助于孩子在今后享有应有的权益，比如继承男方的财产、获得男方的抚养和教育支持等。如果没有通过亲子鉴定明确亲子关系，可能会在孩子的权益保障方面出现纠纷和问题。

   在实际操作中，不同地区的户籍管理政策可能会有所差异。如果你对要求做亲子鉴定的规定存在疑问，可以进一步向当地户籍管理部门咨询具体的政策依据和操作流程。