非婚生子有出生证明但上男方户口仍需亲子鉴定，主要基于以下几方面原因：

    防止户籍管理漏洞

    避免虚假出生证明

   在现实生活中，存在一些不法分子伪造出生证明的情况。非婚生育本身在生育过程和家庭关系的认定上相对复杂，为了防止有人利用虚假的出生证明将孩子户口登记到男方名下，比如为了获取某些利益（如拆迁补偿、入学资格等）而编造亲子关系，户籍管理部门要求进行亲子鉴定以确保出生证明的真实性和孩子与男方的真实亲子关系。

    维护户籍信息准确性

   准确的户籍信息是国家进行人口管理、社会资源分配等工作的基础。通过亲子鉴定可以保证户籍信息中亲子关系的准确性，避免错误的户籍登记对后续的社会管理和公共服务造成不良影响。例如，在一些涉及财产继承、福利分配等问题时，如果户籍上的亲子关系不准确，可能会引发一系列法律纠纷和社会问题。

    明确亲子关系的法律要求

    保障男方权益

   非婚生育情况下，男方可能并非孩子生物学上的父亲。要求进行亲子鉴定可以让男方在法律上确认亲子关系，避免因误认亲子关系而承担不必要的法律责任和经济负担。例如，如果男方被错误地登记为孩子的父亲，后续可能需要承担抚养义务，而进行亲子鉴定可以明确其是否真正负有这一责任。

    保障孩子权益

   从孩子的角度来看，亲子鉴定可以确保其在法律上能获得应有的权益。比如在涉及男方的财产继承、社会福利享受等方面，通过准确的亲子关系认定，孩子可以依法享有相应的权利。同时，也有助于孩子在成长过程中建立明确的身份认同和家庭关系。

    遵循相关法律规定

   根据我国相关法律和户籍管理政策，对于非婚生育子女户口登记，为了明确亲子关系，保障各方权益，往往要求提供亲子鉴定证明。这是为了使户籍登记工作更加规范、合法，符合法律程序和社会公共利益。