店里员工私自偷拿店里现金两万多，报警后通常会按以下步骤和方式进行处理：

    公安机关受案与初查

    接警与登记 ：当你向公安机关报警后，警方会详细记录案件情况，包括案发时间、地点、被盗现金数额等关键信息。

    初查 ：公安机关会对案件进行初步调查，判断是否达到立案标准。根据相关司法解释，盗窃公私财物价值一千元至三千元以上属于数额较大，两万多元已远超此标准，一般会予以立案。

    立案侦查

    展开调查 ：警方立案后会展开全面侦查工作。这可能包括询问店主、其他员工等相关人员，了解案发前后的具体情况，查看店内监控视频以确定嫌疑人的作案过程和身份，收集现场可能留下的指纹、脚印等痕迹证据。

    锁定嫌疑人 ：通过调查，警方会锁定偷拿现金的员工，并对其采取相应的强制措施。通常情况下，如果证据确凿，会对嫌疑人进行传唤，要求其到公安机关接受调查。若符合拘留条件，会对其进行刑事拘留。

    审查起诉

    移送检察院 ：经过侦查，公安机关认为犯罪事实清楚，证据确实、充分的，会将案件移送至人民检察院审查起诉。在移送时，会将所有的证据材料，如监控视频、证人证言、犯罪嫌疑人的供述等一并提交给检察院。

    检察院审查 ：检察院会对公安机关移送的案件进行全面审查，包括对证据的合法性、真实性和关联性进行审查，讯问犯罪嫌疑人，听取被害人的意见等。如果检察院认为犯罪嫌疑人的犯罪事实已经查清，证据确实、充分，依法应当追究刑事责任的，会向人民法院提起公诉。

    审判

    法院审理 ：人民法院会对检察院提起公诉的案件进行审理。在庭审过程中，会组织控辩双方进行举证、质证和辩论。犯罪嫌疑人可以委托律师为其进行辩护，维护其合法权益。

    量刑判决 ：根据《中华人民共和国刑法》第二百六十四条规定，盗窃公私财物，数额较大的，或者多次盗窃、入户盗窃、携带凶器盗窃、扒窃的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单处罚金；数额巨大或者有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。两万多元一般属于数额较大的范畴，法院会根据具体的犯罪情节、嫌疑人的认罪态度等因素，依法作出判决。

    退赃与赔偿

    退赃 ：如果犯罪嫌疑人主动退还所偷拿的现金，这在量刑时会被作为从轻处罚的情节予以考虑。如果犯罪嫌疑人没有主动退赃，公安机关、检察院和法院在办案过程中会依法追缴赃款，返还给店主。

    赔偿 ：除了退还被盗现金外，如果因为员工的盗窃行为给店铺造成了其他经济损失，店主还可以通过刑事附带民事诉讼的方式，要求犯罪嫌疑人进行赔偿。