非婚生子女有出生证明但上男方户口仍被要求做亲子鉴定，主要基于以下几方面原因：

    明确亲子关系

    出生证明证明力有限

   出生证明虽然是孩子出生情况的一种证明，但它本身并不能完全确凿地证明孩子与男方的亲子关系。在非婚生育的情况下，出生证明可能仅记录了母亲的信息，或者虽然有父亲信息，但可能存在误登、虚假登记等情况。例如，有的女方可能为了给孩子一个完整的出生证明随意填写父亲信息，所以需要通过亲子鉴定这种科学手段来准确认定父子关系。

    避免户籍管理漏洞

   户籍是一项非常严肃的社会管理制度，要求准确登记人口信息。如果不进行亲子鉴定就仅凭出生证明为非婚生子女办理随父落户，可能会出现冒认父亲身份的情况，导致户籍信息不准确，影响社会管理秩序。比如，有人可能为了让孩子获得更好的教育资源或其他福利，冒认有当地户籍的男子为父亲，通过亲子鉴定可以有效避免此类情况的发生。

    遵循法律规定

    维护合法权益

   根据相关法律规定，在确定非婚生子女的抚养权、继承权等权益时，亲子关系的认定至关重要。要求进行亲子鉴定可以确保男方在法律上真正承担起对孩子的抚养义务，同时也保障孩子享有相应的合法权益。例如，孩子日后可能涉及到继承男方财产的问题，如果没有准确的亲子关系认定，可能会引发财产纠纷等一系列法律问题。

    符合户籍政策

   各地的户籍政策对于非婚生子女落户有明确的规定，很多地方要求通过亲子鉴定来确认亲子关系后才能办理随父落户手续。这是为了规范户籍管理，防止出现户籍造假等违法行为，确保户籍制度的公平、公正和有序运行。