非婚生子有出生证明，上男方户口时仍被要求做亲子鉴定，通常有以下几方面原因：

    防止户籍管理漏洞

    避免虚假出生证明 ：在现实生活中，存在一些人利用虚假出生证明来为孩子落户的情况。虽然你持有出生证明，但由于是非婚生育，相关情况相对复杂，户籍管理部门为了确保出生证明的真实性以及孩子与男方之间真正存在生物学亲子关系，需要通过亲子鉴定来进行核实，以避免不法分子利用虚假证明骗取户籍登记，维护户籍管理秩序。

    防止代孕等违法行为 ：代孕在中国是明确的违法行为。非婚生育情形下，为了排除代孕等违法可能，通过亲子鉴定来确定孩子与申报落户的男方之间具有血缘关系，确保落户行为符合法律规定和社会公序良俗。

    明确亲子关系及权利义务

    确定法定抚养责任 ：上男方户口意味着男方要承担相应的抚养等法律责任。通过亲子鉴定明确亲子关系，能在法律层面上确定男方对孩子的抚养义务，保障孩子的合法权益，避免日后可能出现的抚养纠纷。

    保障男方权益 ：从男方角度看，亲子鉴定也能保障其自身权益。在确认亲子关系后，男方在涉及财产继承、监护权等方面的权利和义务也能更加明确，避免后续可能出现的争议。

    遵循户籍管理政策

    地方政策要求 ：不同地区的户籍管理政策存在一定差异。有些地方为了加强对非婚生育子女落户的管理，会要求提供亲子鉴定证明作为落户的必要材料之一，以规范户籍登记流程，确保人口信息的准确性和真实性。