非婚生子有出生证明但上男方户口仍要求做亲子鉴定，主要有以下几方面原因：

    防止户籍管理漏洞

    避免冒认身份 ：在非婚生育的情况下，可能存在一些人出于各种目的，比如为了获取某些利益（如房产继承、拆迁补偿等），试图将孩子户口登记到男方名下。要求进行亲子鉴定可以有效防止他人冒认父子关系，确保户籍信息的准确性和真实性，维护正常的户籍管理秩序。

    打击违法犯罪 ：有些犯罪分子可能会利用出生证明进行非法的儿童交易、拐卖儿童后为孩子上户口等违法活动。通过亲子鉴定能够进一步核实孩子与男方的生物学关系，从户籍管理层面打击相关违法犯罪行为。

    明确亲子关系的法律要求

    保障男方权益 ：虽然有出生证明，但出生证明仅能证明孩子出生的事实，不能确凿地证明孩子与男方存在生物学上的亲子关系。进行亲子鉴定可以从法律上明确亲子关系，保障男方的知情权和合法权益，避免男方在不知情的情况下承担非亲生子女的抚养等责任。

    遵循法律程序 ：根据我国相关户籍管理规定和司法实践，非婚生子女上户口时，为了确保亲子关系的合法性和准确性，需要通过亲子鉴定来提供具有法律效力的亲子关系证明。这是为了遵循严格的法律程序，保障各方的合法权益。

    出生证明的局限性

    信息可能不准确 ：出生证明的信息是根据产妇或相关人员提供的情况填写的，可能存在信息不准确或虚假的情况。比如，产妇可能出于某些原因误报或故意错报孩子父亲的信息。因此，需要通过亲子鉴定这种科学的方法来准确确定亲子关系。