如果遇到已满16岁的女生最初自愿发生性关系，之后又指控强奸的情况，可以从以下几个方面应对：

    收集、保留证据

   1. 聊天记录

   仔细查看与该女生之间的聊天软件记录，包括微信、短信、QQ等。如果聊天内容能够体现出女生是自愿的态度，比如有表达期待见面、亲密互动意愿等内容，这些都可以作为重要证据。

   2. 视听资料

    - 查看事发地附近是否有监控摄像头，例如酒店、街道等公共场所的监控，监控视频可能记录下双方进入场所时的状态，比如是否存在拉扯、强迫等迹象。

    - 如果事发过程中有拍摄照片或视频（需强调的是，私自拍摄此类内容可能存在侵犯隐私等法律风险，但如果客观存在且能证明自愿情况，可作为证据），也可以保留。

   3. 证人证言

   如果事发时有其他证人在场，比如酒店工作人员看到双方进入房间时的状态、朋友知晓你们之间的关系和互动情况等，要及时与证人沟通，请他们如实作证。

   4. 就医记录

   如果在发生性关系过程中没有暴力强迫迹象，女生身体也无明显损伤，相关的就医检查记录（若有）也可以辅助证明不存在强迫行为。

    配合调查

   1. 如实陈述

   当警方介入调查时，要保持冷静，如实向警方陈述事情的经过，包括相识过程、事发的时间、地点、具体情节等。不要隐瞒或歪曲事实，否则可能会给自己带来更不利的后果。

   2. 遵守程序

   严格按照警方的要求配合调查，比如按时到指定地点接受询问、提供相关证据等。积极配合调查有助于尽快查明事实真相。

    寻求法律帮助

   1. 委托律师

   尽快委托专业的刑事辩护律师。律师具有专业的法律知识和丰富的办案经验，能够为你提供全面的法律帮助。律师可以在侦查阶段为你提供法律咨询、代理申诉、控告等服务，在后续的审查起诉和审判阶段为你进行有效的辩护。

   2. 听从律师建议

   律师会根据具体情况制定合适的辩护策略，要充分信任律师，听从律师的专业建议，积极配合律师开展工作。

   根据《中华人民共和国刑法》规定，强奸罪是指违背妇女意志，使用暴力、胁迫或者其他手段，强行与妇女发生性交的行为。如果能够证明女生是自愿的，那么就不构成强奸罪。但整个过程需要依靠充分的证据和合法的程序来维护自己的合法权益。