商标侵权调解后，是否可以不予处罚需分情况讨论。以下是对此问题的详细分析：
一、民事层面调解的影响

1. 协商解决与免罚：在民事层面，若商标侵权纠纷的双方通过调解达成和解，且侵权人自愿停止侵权行为并赔偿损失，这通常意味着双方已就纠纷的解决方式达成一致。根据《中华人民共和国商标法》的相关规定，虽然调解本身并不直接导致行政处罚的免除，但侵权人的积极赔偿和停止侵权行为可能作为量刑或处罚时的从轻情节予以考虑。
2. 民事赔偿的替代性：调解成功后，被侵权人可能不再追究侵权人的民事责任，如要求赔偿损失等。然而，这并不意味着侵权人完全免除了所有法律责任，特别是当侵权行为同时构成行政违法或刑事犯罪时。
   二、行政层面调解与处罚的关系
3. 行政处罚的独立性：行政机关对商标侵权行为的查处和处罚是基于其行政职权和法律规定，不受民事调解结果的影响。即使双方达成调解协议，行政机关仍可能根据侵权行为的性质和情节，依法对侵权人进行行政处罚。
4. 不予行政处罚的例外：根据《中华人民共和国行政处罚法》的相关规定，对于初次违法且危害后果轻微并及时改正的商标侵权行为，行政机关可能依法不予行政处罚。这种情况下，调解成功并积极改正可能成为不予处罚的考量因素之一。
   三、刑事层面调解与刑事责任
5. 刑事责任的不可免除性：若商标侵权行为构成犯罪，如假冒注册商标罪等，即使双方达成调解协议并取得被侵权人的谅解，侵权人仍可能面临刑事责任的追究。刑事责任是针对犯罪行为的法律制裁，其免除需严格依据刑事法律的规定。
6. 调解作为量刑情节：在刑事诉讼中，调解成功并取得被侵权人谅解的，可以作为量刑时的从轻情节予以考虑。但这并不意味着可以完全免除刑事责任，而是可能在刑期、罚金等方面予以减轻。