当别人借车后扣了12分不处理时，车主应首先明确责任归属，再依法处理违章记录，并采取措施预防后续纠纷。具体处理步骤如下：
一、明确违章情况与责任人

1. 查询违章记录：车主需通过交通管理部门的官方网站、APP或前往交警大队，查询详细的违章记录，包括违章时间、地点、违章代码、罚款金额及是否有记录驾驶人信息。
2. 确定实际驾驶人：根据违章记录，尝试确定具体的驾驶人。若能明确驾驶人，应与其沟通，说明违章情况及可能后果，要求其配合处理。
   二、依法处理违章记录
3. 驾驶人处理：若驾驶人明确且同意配合，驾驶人需携带驾驶证、身份证及车辆行驶证至交警大队接受处罚，包括扣分和缴纳罚款。依据《中华人民共和国道路交通安全法》第一百一十四条，公安机关交通管理部门可根据交通技术监控记录资料对违法驾驶人进行处罚。同时，根据《中华人民共和国道路交通安全法》第一百零八条，罚款应在收到罚款行政处罚决定书之日起十五日内缴纳。
4. 车主处理（驾驶人无法确定或拒绝配合）：若驾驶人无法确定或拒绝配合，车主可能需要先行承担违章责任，包括缴纳罚款。车主应前往交通管理部门填写交通违法当事人自愿接受处罚确认书，并在收到罚款行政处罚决定书之日起十五日内到指定银行缴纳罚款。事后，车主有权向实际驾驶人追偿。
   三、后续管理与预防
5. 签订书面协议：与借车人签订书面借车协议，明确双方在车辆使用过程中的权利和义务，特别是违章处理责任。
6. 定期查询违章信息：养成定期查询车辆违章信息的习惯，及时发现并处理违章，避免积累过多造成麻烦。