固定总价合同不可预见费结算是否扣除需视合同约定及实际情况而定。以下是对此问题的详细分析：
一、合同约定优先

1. 明确约定：若合同中已详细规定了不可预见费的使用范围、触发条件及结算方式，则应严格按照合同约定执行。例如，当工程变更导致的费用增加在特定幅度内时，应从不可预见费中支出，此时可能涉及扣除操作。
2. 约定模糊或未约定：若合同对此未作规定或规定不明确，双方需进行协商，并可参考行业惯例、类似项目处理方式及相关法律法规来达成补充协议，以确定不可预见费在结算时是否扣除及如何扣除。
   二、实际情况考量
3. 事件性质：判断发生的事件是否属于不可预见范畴，如自然灾害、政策变动或地质异常等。这些事件通常是在项目规划和预算编制时无法预见的，若因此导致费用增加，且符合合同约定或双方协商的结果，则可能从不可预见费中扣除相应费用。
4. 费用核算：根据实际发生的不可预见事件，遵循合理、公正原则进行费用核算。核算内容包括材料费、人工费、设备租赁费等，确保费用的真实性和合理性。若核算后的费用在不可预见费范围内，则按约定扣除；若超出范围，则需双方协商分担方式。
   三、结算流程与争议解决
5. 结算流程：承包方应提交包含费用明细和证明材料的结算报告，发包方按约定程序审核并支付费用。在此过程中，双方应确保结算的透明性和公正性。
6. 争议解决：若双方在不可预见费结算问题上产生争议，应首先通过友好协商解决；协商无果的，可邀请第三方进行调解；调解仍无法解决的，可根据合同中的仲裁条款或通过诉讼方式解决争议。