高三学生档案父母是个体户，一般不可以直接盖自己父母的公章，需根据具体情况判断。以下是对此问题的详细分析：

一、个体工商户公章的使用范围

1. 合法经营相关：个体工商户的公章主要用于其合法经营的业务活动，如签订合同、开具发票、办理工商税务等事务。这些活动均与个体工商户的经营直接相关。
2. 非经营相关限制：对于与个体工商户经营业务无关的事项，如学生档案、个人证明等，一般不应使用个体工商户的公章。此类盖章可能不具有法律效力，甚至可能带来法律风险。

二、高三学生档案盖章的特殊要求

1. 档案的真实性与权威性：高三学生档案是记录学生学习经历、成绩、表现等重要信息的文件，具有高度的真实性和权威性。因此，档案的盖章单位通常需要具备一定的资质和公信力。
2. 个体工商户的局限性：尽管个体工商户是合法的经营主体，但其公章在档案盖章方面可能不被广泛接受或认可。因为个体工商户的公章主要代表其经营身份，而非教育或档案管理的权威机构。

三、可行的解决方案与建议

1. 联系学校或教育部门：对于高三学生档案的盖章问题，最直接且有效的方法是联系学生所在的学校或当地教育部门。他们可以提供具体的盖章要求和指导，确保档案的合法性和有效性。
2. 寻找其他权威机构：如果学校或教育部门无法提供盖章服务，可以考虑寻找其他具有公信力的机构进行盖章，如社区服务中心、街道办事处等。这些机构通常具备一定的社会管理和服务职能，其公章在档案盖章方面可能更具权威性。