这种情况您叔叔未经合法授权拿走补偿款的行为可能侵犯了您母亲的合法权益。以下为您分析可能的解决途径：

    沟通协商

   您可以先和叔叔进行沟通，明确告知他这笔补偿款是属于您母亲的，要求他尽快归还。在沟通时，注意保留相关的聊天记录、通话录音等，以防后续需要作为证据使用。可以邀请家族中比较有威望的长辈一起参与协商，这样可能会让沟通的氛围更加缓和，也有助于问题的解决。

    收集证据

   如果沟通协商无法解决问题，就需要为可能的法律途径做准备，证据收集至关重要：

    补偿协议 ：找到煤矿与您母亲签订的关于房屋补偿的协议，协议中会明确补偿的金额、补偿对象等关键信息，这是证明款项归属您母亲的核心证据。

    款项支付凭证 ：查询补偿款的支付记录，比如银行转账记录等，确定款项确实支付给了您叔叔。

    证人证言 ：如果有其他人知晓补偿款的情况，比如当时参与协商补偿事宜的村干部、邻居等，可以请他们出具证人证言。

    法律途径

    发送律师函 ：在掌握充分证据后，可以委托律师向您叔叔发送律师函，正式告知他其行为的违法性，并要求他在一定期限内返还补偿款。律师函具有一定的威慑力，有可能促使您叔叔主动归还补偿款。

    提起诉讼 ：如果律师函没有起到作用，您母亲可以作为原告，以不当得利为由向法院提起诉讼，要求您叔叔返还90万元补偿款。在诉讼过程中，要积极配合法院的工作，按照法院的要求提供证据、参加庭审等。

   法律依据方面，《中华人民共和国民法典》第九百八十五条规定，得利人没有法律根据取得不当利益的，受损失的人可以请求得利人返还取得的利益。在您描述的情况中，您叔叔没有合法依据拿走属于您母亲的补偿款，符合不当得利的构成要件，您母亲有权要求他返还。