司法协商分期付款后是否会结案需要分情况来看，以下从不同场景为你详细分析：

    民事案件

    执行阶段达成和解

    - 在民事案件进入执行程序后，双方当事人达成司法协商分期付款的和解协议。根据法律规定，这种情况下法院一般会裁定中止执行，而非直接结案。

    - 例如，甲起诉乙要求偿还借款 10 万元，法院判决乙偿还后，案件进入执行程序，甲乙经协商达成乙分 3 期偿还借款的和解协议，法院通常会裁定中止执行。

    - 如果被执行人按照和解协议按时、足额履行了分期还款义务，那么执行案件就会以执行完毕方式结案。但要是被执行人不履行或者不完全履行和解协议，申请执行人可以申请恢复原生效法律文书的执行，此时案件会继续执行，不会结案。

    诉讼阶段达成调解

    - 在诉讼过程中，双方当事人在法院主持下达成包含分期付款内容的调解协议。法院会根据调解协议制作民事调解书，当双方当事人签收民事调解书后，诉讼程序就会终结，案件也就结案了。

    - 比如，丙与丁因合同纠纷诉至法院，在法院调解下，双方达成丁分 2 期向丙支付合同款项的调解协议，法院据此制作并送达调解书后，该案件即告结案。不过，如果一方不履行调解书确定的义务，另一方可以向法院申请强制执行。

    刑事案件

   - 刑事案件中涉及民事赔偿部分，若被告人与被害人就民事赔偿达成司法协商分期付款协议，刑事部分的诉讼程序通常会按照法律规定继续进行，不会因民事赔偿的分期协议而结案。

   - 例如，在故意伤害案件中，被告人除了要承担刑事责任外，还需对被害人进行民事赔偿。双方就民事赔偿达成分期付款协议后，法院依然会对被告人的刑事责任进行审判。只有当刑事审判程序全部完成，如作出判决且判决生效等，刑事案件才会结案。