非婚生子有出生证明但上男方户口仍需亲子鉴定，主要基于以下几方面原因：

    防止冒名登记

   出生证明虽然是孩子出生的重要凭证，但存在伪造、冒用等风险。在非婚生育的情况下，可能存在一些人为了达到让孩子落户等目的而使用虚假出生证明的情况。通过亲子鉴定可以确定孩子与男方之间的生物学亲子关系，避免将他人的孩子错误地登记在男方户口上，保障户籍信息的真实性和准确性。

    明确亲子关系

   在法律上，非婚生子女的亲子关系不像婚生子女那样基于婚姻关系有较为明确的认定。出生证明上登记的父亲信息，可能只是产妇自行填写或双方自行确认的，没有经过法律程序的严格认定。而亲子鉴定是一种科学、准确的方法，能够从生物学角度明确孩子与男方之间是否存在亲子关系，以确定男方对孩子负有相应的法律权利和义务，比如抚养权、继承权等。

    遵循户籍管理规定

   为了规范户籍管理，防止非法落户等情况的发生，公安机关通常会要求提供亲子鉴定报告等材料来证明亲子关系。特别是对于非婚生子女随男方落户的情况，要求进行亲子鉴定是户籍管理部门遵循相关政策和规定的操作，以确保户籍登记符合法定程序和要求。

   一般来说，只要按照相关流程进行亲子鉴定，拿到具有资质的鉴定机构出具的亲子鉴定报告，就可以顺利为孩子办理落户手续。